中国生物制品学杂志

2021, v.34(02) 181-185

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2009—2018年辽宁省急性弛缓性麻痹监测中肠道病毒A组71型VP1区基因特征分析
Genetic characteristics of VP1 region of enterovirus group A type 71 in surveillance of acute flaccid paralysis in Liaoning Province,China from 2009 to 2018

任丽萍;邵玉平;陈涛;王艳;方兴;韩悦;姚文清;

摘要(Abstract):

目的分析辽宁省2009—2018年急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例中人肠道病毒A组71型(EV-A71)VP1区的基因特征。方法对辽宁省2009—2018年AFP病例的粪便标本进行病毒分离,将分离到的非脊髓灰质炎肠道病毒(non-polio enterovirus,NPEV)进行RT-PCR,将阳性产物进行VP1区序列测定。用BioEdit软件对分离株VP1区序列与EV-A71 C4亚型的C4a分支及EV-A71原型株进行同源性比对;根据EV-A71 VP1编码区全长,采用Neighbor-Joining方法构建所获分离株及从GenBank下载的EV-A71各基因型及亚型代表株的进化树,并用Mega4.0软件分析。结果共检测1 044例AFP粪便标本,99例标本分离到NPEV,其中11例标本的分离株为EV-A71;此11株分离株VP1区核苷酸及氨基酸与C4亚型的C4a分支同源性分别为96.5%~98.3%和98.6%~99.3%;与EV-A71原型株同源性分别为81.1%~82.2%和93.6%~94.7%;11株EV-A71之间核苷酸及氨基酸同源性为95.5%~100%和98.6%~100%。进化树分析表明,辽宁省EV-A71分离株与C4亚型的C4a分支处于同一支。结论辽宁省11株EV-A71分离株为密切相关的一簇,来源于同一传播链,为C4亚型中的C4a进化分支。本文为辽宁省AFP监测提供了病原学依据。

关键词(KeyWords): 肠道病毒A组71型;急性弛缓性麻痹;非脊髓灰质炎肠道病毒;VP1区;基因特征

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家科技重大专项(2017ZX10103007-001);; 辽宁省2018年重点研发计划(2018225043)

作者(Author): 任丽萍;邵玉平;陈涛;王艳;方兴;韩悦;姚文清;

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DOI: 10.13200/j.cnki.cjb.003269

参考文献(References):

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